健全工作机制。崇明区联席办于年初和年中先后2次组织召开全区性非法客运整治专题会议，对非法客运整治阶段性工作进行部署，制定并下发《2018年崇明区整治非法客运工作实施方案》、《2018年度本区整治非法客运考核标准》和《2018崇明区整治非法客运宣传工作方案》，明确了各相关单位的职责分工，同时制定三个市级重点整治区域“一点一方案”，细化整治工作任务和措施。
开展专项行动。崇明区交通执法部门积极会同公安等部门优化联勤联动工作机制，采取集中与分散相结合、定时整治与错时稽查相结合、加强管理与重点布控相结合等措施，机动灵活地开展专项整治行动，坚决查处各类非法客运行为，进一步加强非法客运的整治力度。发动乡镇对市通郊非法客运车辆尤其是夜间班线车进行排摸，进一步摸清底数，结合错时执法，道口设卡等方式，有针对性在陈家镇G4O道口、长兴岛交通枢纽等地开展“市通郊线路”非法客运专项整治行动，严厉查处“市通郊线路”非法客运车辆。聚焦上下班高峰时段和节假日潮汐式出行等高客流时段，加强对公交枢纽、相关公共服务机构的巡查布控，精准打击违规网约车。
强化源头管控。在南门水陆换乘中心周边的南门路、一江山路设置花箱护栏，在长兴公交枢纽周边的长橘路、崇明新城地区宝岛路、松翠路、翠竹路等道路新装及更换各类护栏4050米。在陈家镇公交枢纽周边安装了违停抓拍探头，进一步完善物防技防设施，健全源头发现机制。调整优化公交线网，开通定制公交e乘巴士崇明1号线（南门水陆换乘中心——长江南路临时公交枢纽）、e乘巴士崇明2号线（新海镇跃进场部——长江南路临时公交枢纽）和e乘巴士崇明3号线（陈家镇公交枢纽-浦东北路），进一步满足市民多样化的出行需求。同时在市级部门的支持下协调客运企业开通崇明南门至淞南新村、南门至顾村大家园、新河至顾村大家园、新民至顾村大家园、堡镇至顾村大家园的5条定制客运线路，解决崇明籍出租驾驶员夜间市通郊通勤的瓶颈问题，从源头上挤压非法客运的生存空间。
加大宣传力度。开展“六个进”主题宣传活动。在本区枢纽、社区、车厢、学校等非法客运车辆集中区域张贴宣传海报、悬挂宣传横幅，在电子屏上滚动播放宣传视频，广泛宣传乘坐非法客运的危害性。多次邀请电视台、电台及平面媒体对非法客运整治工作进行针对性宣传报道，向广大市民群众公告新开辟的公交及定制客运线路信息，报道执法部门工作动态，引导市民群众“安全出行、拒乘黑车”。推进属地化宣传。各乡镇因地制宜，以“科普早市”、志愿者活动等为平台，通过电子显示屏、悬挂横幅、张贴海报、发放宣传手册等多种方式，深入开展非法客运整治宣传活动，营造良好舆论氛围。