崇明岛露出水面以来的1400年间，沧海桑田，白云苍狗，五代初设“镇”，南宋置“场”，元朝升作“州”，明朝降作“县”，沦陷期改为“特别区”，抗战胜利恢复为“县”，2016年建“区”，行政区的名称、级别、治所、隶属，以及官署的名称、主官、下辖等等，都曾随之变更。
唐
武德年间
唐高祖武德初年（618~626），海门县南面江中，东西相对两个沙洲露出水面，距离约70里，时人以方位辨识之，东边的称之为东沙，西边的称之为西沙。这东、西两沙，就是崇明岛的前身、初始。
唐
通天元年
随着时间推移，东、西两沙面积渐大，地形渐高，女皇武则天万岁通天元年（696），开始有人登陆居住，打渔晒盐、耕稼力田，生生不息。据1989年版《崇明县志大事记》，五代杨吴天祚三年（937），在西沙设“崇明镇”，“崇明”之名始于此。
新唐书兵志
据《新唐书兵志》：“兵之戍边者，大曰军，小曰守捉，曰城，曰镇。”当时的镇，多数设在边远的小军事据点，崇明地方虽然不大，但地处长江口头、东海之滨，外控夷岛，内蔽苏松，又为东南半壁之支，地位显要，因而设镇于此驻兵戍守。
崇明镇隶属于通州海门县，镇署长官称镇使或镇将，统领兵丁500名，管理民政、治安。
古来称地方官府办公机构的所在地为治所，崇明镇的镇署在西沙，西沙成了崇明镇的治所。
崇明岛是在众多江口沙洲的涨塌过程逐渐形成的。继东沙、西沙后，从北宋到明朝，先后又有姚刘沙、三沙、平洋沙、长沙等主要沙洲涨出，都曾繁荣一时，在崇明建置沿革史上占有显著地位。
南宋
嘉定年间
历史上的崇明盛产海盐，滩涂上盐田毗连，盐灶星罗棋布，生盐熟盐堆积如山。南宋嘉定十五年（1222），在三沙原韩侂胄废庄设“场”，因附近有天赐港，故称“天赐盐场”。天赐盐场的治所在三沙。隶属于通州管辖，级别与县相同。
两宋的场，属专业性管理机构。顾名思义，天赐盐场专事掌管崇明的盐课，包括盐丁、盐户、盐灶、制盐、销售、税收。在三沙设官署——盐课提举司，配备主官——盐课提举。提举，宋朝主管专门事务的职官，诸如盐课提举、市舶提举、医学提举、宝钞提举等等。
元
元朝初年
元朝初叶，崇明沙洲渐多渐大，鱼、盐、农各业兴旺，居民高达一万二千户以上。广西横州知州薛文虎奉朝廷之命，来崇明考察，此君以崇明系边陲要塞，户增人繁，于元世祖至元十四年（1277）奏请朝廷批准，将崇明由原来的镇升为“州”，崇明州隶属扬州路。
元代的行政区的设置，自上而下为行省、路、州（府）、县，当时崇明州的区划，相当于现在的地区级。
崇明州的治所在姚刘沙，首席长官是知州，由朝廷委任，第一任知州为薛文虎，掌本州民政，下有判官、吏目、学政、训导、教授、巡检、医学等属官，协助分理刑狱、文书、学堂、教化、治安等事项。薛知州上任后，在姚刘沙建造州城，这是崇明有治城的开始，而以前的镇、场，只有官署而无城池，只有治所而无治城。
元
元朝末年
元朝末年，天下大乱，兵连祸接，崇明也难逃劫数，又因东沙、西沙等沙洲坍没，人祸天灾，居民或丧生或外迁，明朝开国之初的太祖洪武二年（1369），以地坍户减，崇明改州为“县”，治所姚刘沙，仍然隶属于扬州路管辖。
唐代前
唐代以前，县的主官称县令或县长，宋代的一县之长称知（主持）县事，简称知县，管理一县行政，有的兼管军事，明朝也称知县。崇明降州为县后，设知县一名，首任知县胡兴福，正七品，俗称“七品芝麻官”，胡知县的助手有县丞、主簿、典吏、教谕、巡检等。
明
洪武八年
明朝建立之初，行政区划沿袭元朝的行省、路、州（府）、县制，后取消了路，原来的扬州路已改为扬州府，加之崇明离扬州太远，遂于洪武八年（1375），将崇明县改由苏州府管辖，治所仍是姚刘沙。
明
弘治十年
孝宗弘治十年（1497）太仓建州，属苏州府管辖。太仓就在崇明南岸半江之隔，出于就近管理的考量，崇明县原属苏州府的同时，兼隶于太仓州，治所还在姚刘沙。
明
正德年间
在此以前，崇明县管行政区的设置无从考查，明武宗正德年间（1506~1521）开始有记载，县境内设4个乡，下辖6个区、110个里。
图片来源：上海地方志办公室网站
清
雍正二年
清朝雍正皇帝登基后，原来隶属于苏州府的太仓州，升级为直隶州，地位等同于苏州府。雍正二年（1724），崇明县不再置于两个相同级别的上司管辖之下，脱离苏州府而专隶于太仓州。全县仍设4个乡，下辖6个区、110个里。
此时的崇明县治所，因原在姚刘沙的城池遭潮水冲刷坍没，搬到了长沙（今城桥镇），县衙设在原沈邦基宅（今区政府办公处），至今未变。
清
宣统三年
又值改朝换代时，辛亥武昌起义胜利，捷报飞传，各地纷纷响应，满清王朝土崩瓦解。
上海光复后，沪军都督府派人来崇明敦促易帜，宣统三年（1911）11月6日，崇明宣告光复，建立“崇明县军政府”，隶属江苏省军政府，以王绍曾为县军政府民政长。下设总务课、警务课、学务课、实业课、主计课、盐务课，以及审判、典狱等各官，以佐行政，以理司法。
北洋政府
1913年-1914年
1913年1月，北洋政府颁布了《划一现行各省地方行政官厅组织令》，3月，崇明县军政府改组成“崇明县公署”，首席长官为县知事，由王绍曾担任，县公署各课长随之改称科长。全县设城市、堡市和25个乡，直至南京国民政府成立。
1914年5月下旬，按北洋政府省、道、县的设置，江苏省划县为道，6月，崇明县划拨沪海道管辖，县知事费熙栋，下设第一（民政）科、第二（财政）科、第三（教育）科。
图片来源：上海地方志办公室网站
南京政府
1927年-1934年
南京国民政府成立，道撤销，原沪海道各县仍隶属江苏省，1927年4月，崇明县回归江苏省管理，县知事田良骥，下设第一、第二、第三科，及建设、教育、财政、警务等局。1929年全县设7个区，下辖21个镇、119个乡。
国民政府时期，省以下县以上政区划分行政督察区，1933年3月，江苏省实施行政专员督察区制，以序数命名，崇明县隶属江苏省第七区。
江苏省政府以所划督察区太多而缩减， 1934年崇明县改隶于江苏省第四区，按地处、政事、辖境、富力等情况，定为三等县，全县设5个区，下辖10个镇、86个乡。
民国
1938年
1938年3月18日，崇明被日军侵占，县政府流亡海门县倪家镇。4月1日，日寇扶植的“崇明县自治委员会”成立，以黄稚卿为委员长，下置秘书处及总务、财政、工商、教化、民生、司法等部，不久以经费不继改为5个局。全县设4个分区，下辖3个镇、68个乡。
民国
1938年-1939年
1938年10月16日，伪上海特别市政府成立。12月1日，伪中华民国维新政府行政院颁布《上海特别市管辖区域暂行办法》的训令，将江苏省所辖川沙、南汇、奉贤、宝山、嘉定、崇明等县划归上海特别市，并改县为区。据此，1939年6月，崇明县自治会改组为“崇明特别区”，隶属上海特别市。以黄稚卿为崇明特别区公署署长，下置秘书处，民政、财政、教育、建设4个科，以及保甲股、宣传股、田赋处、社运指导室。
民国
1945年-1946
日本战败投降，抗日战争胜利，1945年8月28日，侵崇日军撤往上海投降。崇明沦陷时流亡去海门的县政府，由县长孙云达率军南渡崇明接收，进驻城桥镇，宣布自9月起恢复沦陷前崇明县的建制，隶属江苏省，县政府置一、二、三、四科，及秘书室、会计室、人事室、警察局、电信局、公款产管理处。全县设5个区、2个镇区，下辖4个镇、89个乡。
1946年2月4日，经国民政府批准，江苏省政府将崇明划还沦陷前的第四行政督察区，重新隶属江苏省第4区（南通）。
11月23日，省政府委员会决定将崇明县划归第三区管辖。12月9日起，崇明县改隶江苏省第三区（松江）。
新中国
1945年-1955年
解放战争打响，1949年5月30日，人民解放军从新河乡海桥港登陆崇明，分兵两路向堡镇和县城挺进。6月1日，堡镇解放。同日，县城守军在强大政治军事压力下被迫无条件投降。6月2日，解放军接管县城，崇明解放，成立崇明县政府，县长姚志仁，隶属江苏省南通专区。全县设4个区、2个镇，下辖21个乡。
1950年7月31日，崇明县政府改称“崇明县人民政府”，县长姚志仁。全县设8个区、2个县属镇，下辖3个镇、67个乡。
1955年12月6日，崇明县人民政府改称“崇明县人民委员会”，咸文和任县长。全县设11个区，下辖3个镇、107个乡。
中国
1958年
1958年11月21日，国务院批准江苏省苏州专区的川沙、青浦、南汇、松江、奉贤、金山6个县和南通专区的崇明县划归上海市管辖。12月1日，崇明县改隶上海市，全县设2个镇、10个人民公社。
中国
文化大革命
文化大革命起，1967年2月23日，上海市革命委员会成立，1968年2月25日，经市革命委员会批准，成立“崇明县革命委员会”，简称“县革会”，作为党政合一的权力机构，县革会召集人为曹子益。
文化大革命结束后，1981年6月25日，复称“崇明县人民政府”，县长陈亮。全县设2个镇、26个人民公社。以及8个市属国营农场和2个军垦农场。
崇明区人民政府成立
2016年7月22日，上海市委、市政府在崇明召开“崇明撤县设区”工作大会，宣布上海唯一的一个县——崇明县撤县设区，2017年1月10日，崇明区第一届人民代表大会召开，选举产生区长、副区长,第一任区长唐海龙。至此，崇明区人民政府成立。
以上内容由陆茂清提供