南昌海关通关模式不断更新换代，通关效率大幅提升。改革开放40年，从口岸报关、转关报关，到“属地申报，口岸验放”，2017年10月1日全面实施出口通关一体化，彻底消除了对企业申报通关的地域限制，实现了“全国是一关，一关通天下”。报关也从人工比对审核到目前“电子数据申报”后再“现场接单”，只需要短短几分钟的时间。
尤其是“互联网+海关”一体化平台全面推广，南昌海关行政审批事项全部通过平台申请，企业单证全部通过网上申报，企业99.75%的报关单实现了无纸化，96.5%的税费实现了电子支付，76.7%的税费实现了足不出户、自报自缴，进出境旅客缴纳税款实现了移动支付。记者了解到，外贸进出口通关时间进一步压缩，2018年1-8月，进出口海关通关时间已压缩至0.32和3.79小时。